Herramienta de realidad virtual para ser utilizada en la lucha contra las enfermedades

La ciencia tiene la tecnología para medir la actividad de cada gen en una sola célula individual, y un solo experimento puede generar miles de células de datos. Investigadores de la Universidad de Lund en Suecia ahora han revolucionado la forma en que se analizan estos datos, utilizando tecnología de videojuegos 3D. El estudio se publica en la revista iScience.

Las técnicas avanzadas de secuenciación de ADN y ARN han abierto la posibilidad de estudiar células individuales en tejidos de una manera más completa que nunca. El gran desafío con estas técnicas de secuenciación es que conducen a grandes cantidades de datos.

«Cuando quieras distinguir Células cancerígenas de células normales, por ejemplo, hay que examinar miles de células para comprender completamente, lo que se traduce en enormes cantidades de datos digitales ”, dice Shamit Soneji, investigador de biología computacional de la Universidad de Lund.

Para que estos datos sean comprensibles, cada celda se posiciona matemáticamente en un espacio tridimensional para formar un «mapa de ruta» de las celdas y cómo se relacionan entre sí. Sin embargo, estos mapas pueden ser difíciles de navegar con una computadora de escritorio normal.

“Poder navegar y manipular sus propios datos de manera intuitiva y eficiente les brinda una comprensión completamente nueva. Incluso me atrevería a decir que piensas de manera diferente en la realidad virtual, gracias a la capacidad de la técnica para involucrar a tu cuerpo en el proceso de análisis ”, explica Mattias Wallergård. investigador en diseño de interacción y realidad virtual en la Universidad de Lund.

El equipo de la Universidad de Lund desarrolló el software CellexalVR; a realidad virtual entorno que permite a los investigadores utilizar herramientas intuitivas para explorar todos sus datos en un solo lugar. Mapas 3D de células que se han calculado a partir de la actividad genética y otra información capturada de celdas individuales pueden mostrarse y el investigador puede ver claramente qué genes están activos cuando se forman ciertos tipos de células.

Con un visor de realidad virtual, el usuario tiene un universo completo de poblaciones de células y puede determinar con mayor precisión cómo se relacionan las células entre sí. Usando dos controladores manuales, pueden seleccionar celdas de interés para un análisis más detallado con simples gestos con las manos como si fueran objetos físicos.

Dado que el espacio no es un problema, es posible tener múltiples mapas celulares en la misma «habitación» y compararlos uno al lado del otro, lo cual es difícil en un monitor de computadora tradicional. Los investigadores también pueden reunirse en este mundo de realidad virtual para analizar datos juntos, a pesar de estar en lugares geográficamente diferentes.

“Incluso si no está familiarizado con la programación de computadoras, este tipo de análisis está abierto a cualquiera. mundo virtual es un área de investigación en rápido desarrollo que ha gran potencial para los científicos que necesitan acceder y procesar big data de una manera más interactiva y colaborativa ”, concluye Shamit Soneji.