Rastreador de COVID-19 de Amazon Chicago

Los científicos de Northwestern Medicine Ramón Lorenzo-Redondo y el Dr. Egon Ozer visitaron recientemente el aeropuerto de Iquitos, una remota ciudad peruana en lo profundo de la selva amazónica a la que solo se puede acceder por avión o barco fluvial. Querían conocer a médicos y científicos que brindan atención a las comunidades aledañas a lo largo del río Amazonas.

El motivo del reciente viaje: Iquitos tenía una alta incidencia de COVID-19 al inicio de la pandemia, y querían entender cómo el relativo aislamiento de la gran ciudad influía en la propagación de variantes virales en la región. Perú también tuvo la tasa de mortalidad por COVID-19 más alta durante toda la pandemia, en particular debido a la altísima mortalidad observada durante las primeras fases de la expansión del SARS-CoV-2.

Los viajes de los científicos por América del Sur, que también incluyeron Lima, Perú y Santa Cruz, Bolivia, son un esfuerzo del Dr. Robert J. Havey, del Instituto de Salud Global de la Universidad Northwestern para expandir la red global de secuenciación del SARS-CoV-2. en regiones donde el reporte de información genética viral es bajo o casi inexistente. Quieren ayudar a desarrollar la capacidad de científicos sudamericanos y expertos en salud pública para realizar investigaciones locales.

Lorenzo-Redondo y Ozer forman parte de un equipo del Centro de Genómica de Patógenos y Evolución Microbiana (CPGME), parte del Instituto Havey para la Salud Global. El equipo ha estado estudiando el virus en Chicago y en todo el mundo desde el comienzo de la pandemia. Su equipo ya ha trabajado con colaboradores en África, en los países de Nigeria, Malí y Guinea, para secuenciar cientos de especímenes de COVID-19 de regiones submuestreadas.

“Si observa el depósito público mundial de todas las secuencias de SARS-CoV-2, menos del 1 % son del continente africano y menos del 2 % son de América del Sur”, dijo Ozer, director de CPGME. “Compare eso con América del Norte o Europa, donde se proporciona la gran mayoría de las imágenes. Esto conduce a enormes disparidades en el conocimiento de lo que circula en diferentes partes del mundo.

Crear una colaboración global de científicos de COVID-19

Científicos de la Universidad Northwestern en Lima, Perú (Fuente: Universidad Northwestern)

Los científicos se reunieron con médicos e investigadores de hospitales de Perú y Bolivia para brindar apoyo al estudio de las variantes del SARS-CoV-2 en sus regiones. Esto incluye el envío de algunas muestras a los Estados Unidos para su secuenciación, pero también el suministro de equipos, suministros y capacitación a estas instituciones sudamericanas para que los científicos rastreen el COVID-19 en su país.

El objetivo es tener una red de colaboraciones en todo el mundo para que los científicos puedan trabajar juntos y compartir su experiencia e información para responder rápidamente a los nuevos desarrollos en la pandemia del SARS-CoV-2 y futuros brotes de patógenos emergentes o reemergentes.

“La aparición de una nueva variante en cualquier parte del mundo nos pone a todos en riesgo”, dijo Judd Hultquist, profesor asistente de medicina de enfermedades infecciosas en la Facultad de Medicina Feinberg de la Universidad Northwestern y director asociado de CPGME. “El monitoreo rápido a nivel internacional es esencial para que estemos listos cuando surja la próxima variante”.

Cómo ayudó a Estados Unidos la alerta temprana de Omicron en Sudáfrica

Un ejemplo de este sistema de alerta temprana que funciona bien es la detección temprana de omicron en Sudáfrica, incluso antes de que se detecte omicron en la mayoría de los países.

“Debido a que Sudáfrica estaba secuenciando de manera oportuna, pudieron hacer sonar la alarma un mes antes de que Chicago viera su primer caso de omicron”, dijo Hultquist.

La aparición de una nueva variante en cualquier parte del mundo nos pone en riesgo a todos. ”

Este tiempo extra fue esencial para que los científicos aprendieran más sobre la variante, los riesgos que planteaba y para implementar estrategias de tratamiento adecuadas incluso antes de que llegara a los Estados Unidos.

Científicos sudafricanos descubrieron que muchos anticuerpos monoclonales (anticuerpos específicos administrados a pacientes en estado crítico para unirse a los virus y neutralizarlos) que se usan actualmente para pacientes con COVID-19 no eran efectivos para omicron. Gracias a esta alerta temprana, los médicos estadounidenses pudieron tratar a los pacientes con las terapias más efectivas.

El equipo de Northwest ahora está recapitulando la historia de la pandemia en Chicago desde que se detectó el primer caso de COVID-19 en la ciudad. “Analizaremos los resultados clínicos frente a las variantes y la demografía”, dijo Lorenzo-Redondo, profesor asistente de medicina de enfermedades infecciosas en Feinberg. «Queremos reunir todos los datos para ver los factores de los peores resultados, las diferencias en las variantes y cómo se propaga el virus».

Este estudio informará otros proyectos de investigación iniciados en los círculos de salud global.

El objetivo es encontrar similitudes y diferencias en estos impulsores para ayudar a diseñar estrategias de prevención efectivas de COVID-19, adaptadas global y localmente, así como otros patógenos virales en un futuro próximo.